孔子的性命观载于《孔子家语.本命解》(又 见于《大戴礼记.本命》)，谓:
鲁哀公问于孔子曰:“人之 命与性何谓也?”孔子对:“分于道， 谓之命;形于一，谓之性;化于阴阳，象形而发，谓之生;化穷数尽，谓之死。故命者，性之始也;死者，生之终也。有始则必有终矣。人始生而有不具者五焉:目无见，不能食，不能行，不能言，不能化。及生三月而微煦，然后有见;八月生齿，然后能食;三年囪合，然后能言;十有六而精通，然后能化。阴穷反阳，故阴以阳变;阳穷反阴，故阳以阴化。是以男子八月生齿，八岁而龀;女子七月生齿，七岁而龀,十有四而化。一阳一阴，奇偶相配，然后道合化成。性命之端，形于此也。
按:孔子在《说卦传》中对性命学就有论述，谓:“昔者圣人之作《易》 也,将以顺性命之理，是以立天之道日阴与阳，立地之道日柔与刚，立人之道日仁与义，兼三才而两之，故《易》六画而成卦。”什么是性与命呢?孔子说“命” 来自于天地自然，即大自然遗传给我们的生命体。“性” 来自于父母，即父母遗传给我们的生命体。如《大戴礼记.本命》注引董仲舒曰:“命者 ，天之令也。性者，生之质也。自天得之谓之命，自人得之谓之性。受于火则成仁，受于木则成礼，受于金则成义，受于水则成智，受于土则成信，各得其一，故日‘形于一’ 也。”所谓“自天得之谓之命”，就是来自于大自然的遗传。所谓“自人得之谓之性”，就是来自于父母的遗传。而生死则根于阴阳之化。所以孔子在《系辞传》中说“天地之大德曰生”“生生之谓易”。
公日:“男 子十六精通，女子十四而化，是则可以生民矣。而礼，男子三十而有室，女子二十而有夫也，岂不晚哉?”孔子曰:“夫礼言其极，不是过也。男子二十而冠，有为人父之端。女子十五许嫁，有适人之道。于此而往，则自婚矣。群生闭藏乎阴，而为化育之始。故圣人因时以合偶男女。穷天数之极。霜降而妇功成，嫁娶者行焉。冰泮而农桑起，婚礼而杀于此。
按:男八与十六、女七与十四之语又见于《素问上古天真论》。于此可知，孔子对人体生命科学是有深刻研究的，涉及到人体生命的各个方面，连生育种子时间都有研究，指出人们要依据时候季节来为男女成婚。在冬天闭藏农闲时办婚事，开春后农忙时就停止办婚事。在《倜易》和《月令》中还记载在春分时段天地交泰时合男女而生育。
孔子是个大生物学家，他在《大戴礼记.易本命》说:“夫《易》之生人、禽兽、万物、昆虫，各有以生。或奇或偶，或飞或行，而莫知其情，惟达道德者，能原本之矣。”卢注引孔子曰:“圣人智通于大道，应化而不穷，能测万品之情也。”故孔子能“上律天时，下袭水土” (《中庸》)穷天地间万物之化育，故能知“万物之性各异类”，日“蚕食而不饮，蝉饮而不食，蜉蝣不饮不食，介鳞夏食冬蛰。虼吞者八窍而卵生，咀嚨者九窍而胎生，四足者无羽翼，戴角者无上齿，无角者膏而无前齿，有羽者脂而无后齿。昼生者类父，夜生者类母。...高者为生，下者为死。丘陵为牡，溪谷为牝。蚌蛤龟珠，与月盛虚(王注:“接阴类也。”卢注云:“月者， 太阴之精,故龟蛤之属因之以盛亏。”
《侣氏春秋》云:“日 月望则蚌蛤实，月晦则蚌蛤虚。”《孝经援神契》日:“日月属于天， 则阴类消于渊也。")。”又说:‘“是故坚土之人肥，虚土之人大，沙土之人细，息土之人美,耗土之人醜。是故食水者善游能寒，食土者无心而不息，食木者多力而拂，食草者善走而愚，食桑者有丝而蛾，食肉者勇敢而捍,食谷者智惠而巧，食气者神明而寿，不食者不死而神。”孔子将土型人又分为五种，这正是内经》中将人分为金、 木、水、火、土五类，每一类又分为五种，五五分为阴阳二十五人的源头。这就是孔子说的万物“性命不同”，“乾道变化， 各正性命”，并对中医学产生了重大影响。孙思邈对此发挥说:“《易》 称:天地变化，各正性命。然而变化之迹无方，性命之功难测，故有炎凉、寒燠、风雨、眩冥、水旱、妖灾、虫蝗、怪异、四时、八节种种施化不同，七十二候、日月运行各别，终其咎度，方得成年。
...天地尚且如然，在人安可无事?”(《千金要方.伤寒》) 是天地变化导致了万物“各正性命”。这说明《索问.异法方宜论》和《灵枢.阴阳二十五人》所记是有来源的，现列表于下以供参考。
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